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视频 | 采用AI驱动的药物设计(AIDD),加速化合物设计与ADMET筛选(英文)
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视频 | 采用AI驱动的药物设计(AIDD),加速化合物设计与ADMET筛选(英文)

2020-07-31 16:33:44

视频概述


7月31日凡默谷云课堂《采用AI驱动的药物设计(AIDD),加速化合物设计与ADMET筛选》,由美国Simulations Plus高级首席科学家MichaelLawless和化学信息部总监David Miller主讲。

课程第一部分介绍了理化性质预测模块,包括pKa,化合物在水中和在模拟胃肠液中的溶解度,表征渗透性的预测参数,血浆蛋白结合率,表观分布容积等,并展示了如何预测化合物对应pKa在不同pH下的离子化形式和含量,如何快速预测BCS分类等。

第二部分介绍了代谢预测模块,包括化合物是哪些CYP酶,UGT酶,醛氧化酶的底物,抑制剂,并演示了如何预测代谢位点,代谢产物。

第三部分介绍了转运体模块,包括预测化合物是哪些转运体的底物或抑制剂,如P-gp,BCRP, OATP1B1/1B3, OCT1/2, OAT1/3, BSEP。

第四部分介绍了化合物设计模块Medchem Studio,包括通过骨架等方法进行聚类,选择悬崖分子对,R取代集团分析,SAR分析,化合物相似性筛选,产生衍生物库,通过结构转化规则产生批量新化合物。

最后介绍了AI驱动的药物设计(AIDD)新模块,该方法整合了机器学习,生理药代动力学PBPK等方法,第一步在系统中输入要进行优化的一个或多个种子化合物,并设置要优化的ADMET性质参数,第二步系统将自动产生批量新化合物;第三步进行ADMET,生物利用度,合成难易度等筛选;第四步通过帕累托最优(Pareto-optimal)找出整体最优的一批化合物;如对结果不满意,则通过该流程进行不断的迭代,直到符合预期。 

内容概要


  • ADMET 性质预测

  • 化合物的快速设计

  • AI驱动的药物设计AIDD算法简介与案例演示

讲解人


Michael Lawless,高级首席科学家,美国Simulations Plus

超过20年化学信息与计算化学从业经验,2011年加入美国Simulations Plus,从事AI驱动新药研发工具的开发与应用,并与全球多家制药企业合作不断完善产品。1988年在美国Arkansas大学取得物理化学博士学位。
David Miller,化学信息部总监,美国Simulations Plus
超过20年化学信息软件的编程、开发与应用经验,2005年加入美国Simulations Plus,带领团队开放了ADMET性质预测软件、药物设计软件等,根据全球制药企业、学术单位的反馈不断完善机器学习的方法。1993年于斯坦福大学取得学士学位,1997年在加州大学旧金山分校取得生物物理学博士学位。

课程视频


 

延申阅读


1.【视频】如何进行化合物的ADMET性质评估和化合物设计

2.【视频】化合物设计与结构分析软件Medchem studio简介与应用
3.【视频】化合物设计与结构分析软件Medchem Studio操作演示
4.【视频】ADMET Predictor9.5 理化、代谢、毒性及PK 预测模块介绍及操作

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