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问题解答|ADMET Predictor预测模型的外部预测准确性
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问题解答|ADMET Predictor预测模型的外部预测准确性

2021-01-28 11:41:21

是否有第三方独立评估过ADMET Predictor软件外部预测的准确性,其结果如何?应当怎样合理使用这些预测参数来评估化合物的PK和安全性?


答:

  • 大多数情况下,ADMET Predictor的预测值较为准确,足以对大量化合物进行排序(优劣)。前30%的化合物始终优于后30%的化合物,因此可用于尽早淘汰成药性差的化合物,减少浪费时间和精力;

  • 溶解度:使用4000个化合物评估了不同软件的溶解度预测准备性,ADMET Predictor在同类软件中预测结果准确排名靠前(Sci Total Environ. 2013 Oct 1; 463-464:781-9.);

  • LogP:来自辉瑞和奈科明制药公司96000多个化合物的数据比较了logP的预测准确性,ADMET Predictor预测准确性属于第一系类(J Pharm Sci. 2009 Mar; 98(3): 861-93.)

  • LogP和pKa:比较强生ADME毒理部门发表的文章中50个化合物的logP和pKa的实测数据与ADMET Predictor预测的数据,预测数据与实测数据非常接近;

  • 毒性(黑头呆鱼LD50):使用567个化合物比较了8款软件对黑头呆鱼LD50的预测准确性,ADMET Predictor可较为准确的预测,R2=0.85 (SAR QSAR Environ Res. 2015 Dec; 26(12): 977-999.)

  • 此外,软件所有定性的预测结果还可查看预测结果的可信度(以%表示,如下图左),数值越大,代表预测结果的可信度越大,准确性越高。如果预测结果以红色字体表示(如下图右),则表明结果超出了预测范围(超出训练集范围),预测准确性的置信度较低。

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  • 上一页: 问题解答|查看ADMET Predictor内建模型的预测误差
  • 下一页: 问题解答|如何拓展内建模型的预测范围和化合物结构的多样性
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