问题解答|ADMET Predictor预测模型的外部预测准确性
2021-01-28 11:41:21
是否有第三方独立评估过ADMET Predictor软件外部预测的准确性,其结果如何?应当怎样合理使用这些预测参数来评估化合物的PK和安全性?
答:
大多数情况下,ADMET Predictor的预测值较为准确,足以对大量化合物进行排序(优劣)。前30%的化合物始终优于后30%的化合物,因此可用于尽早淘汰成药性差的化合物,减少浪费时间和精力;
溶解度:使用4000个化合物评估了不同软件的溶解度预测准备性,ADMET Predictor在同类软件中预测结果准确排名靠前(Sci Total Environ. 2013 Oct 1; 463-464:781-9.);
LogP:来自辉瑞和奈科明制药公司96000多个化合物的数据比较了logP的预测准确性,ADMET Predictor预测准确性属于第一系类(J Pharm Sci. 2009 Mar; 98(3): 861-93.)
LogP和pKa:比较强生ADME毒理部门发表的文章中50个化合物的logP和pKa的实测数据与ADMET Predictor预测的数据,预测数据与实测数据非常接近;
毒性(黑头呆鱼LD50):使用567个化合物比较了8款软件对黑头呆鱼LD50的预测准确性,ADMET Predictor可较为准确的预测,R2=0.85 (SAR QSAR Environ Res. 2015 Dec; 26(12): 977-999.)
此外,软件所有定性的预测结果还可查看预测结果的可信度(以%表示,如下图左),数值越大,代表预测结果的可信度越大,准确性越高。如果预测结果以红色字体表示(如下图右),则表明结果超出了预测范围(超出训练集范围),预测准确性的置信度较低。